期刊简介

  本刊多为自由来稿,投稿多为中华医学会医学信息学分会专家成果;编委会以中华医学会医学信息学分会常委为主组成,并适收部分国家卫生部原部属院校图书馆专家,军民四所军医大学图书馆的专家组成。组订多由报刊发行部门征订。编辑部也印刷组订启示下发,以扩大发行范围。


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  • 杂志名称:中华医学图书情报杂志
  • 主管单位:中国人民解放军军事医学科学院
  • 主办单位:解放军医学图书馆
  • 国际刊号:1671-3982
  • 国内刊号:11-4745/R
  • 出版周期:
期刊荣誉:期刊收录:
中华医学图书情报杂志2016年第04期

癌症基因组学相关数据管理与应用探析

沈柳;郭海红;郑思;李姣

关键词:科学数据共享, 开放数据, 癌症基因组图谱, 数据管理
摘要:目的:梳理美国癌症基因组图谱计划相关数据的收集、整理、组织、共享及应用情况,为建立及完善国家级大型的癌症基因组学相关数据开放资源提供参考。方法:系统调研TCGA计划的数据管理相关机构工作流程、数据共享利用等方面的解决方案和佳实践。结果:TCGA计划通过多中心合作,建立了组织样本采集、处理、质量控制、序列测定、特征分析、数据共享与研究应用等全链条的癌症基因组图谱数据管理流程,从所属癌症、数据类型、处理水平等角度对数据进行精细分类,并针对汇总数据和个体数据分别采取开放存取和受控访问两种共享机制,研究者利用其共享数据开展了相关癌症特征基因的突变、扩增和缺失以及受影响的信号通路等多方面研究。结论:癌症基因组图谱计划的实践探索可为大规模癌症基因组学相关研究计划的实施提供数据管理方面的经验与参考。